《灰色：幻影扳機(jī)》故事描述，以培育國防人才為目的的 SORD 與全國各地學(xué)校展開合作。廢校後被閒置的「美濱學(xué)園」被私人收購，成為了「特殊技能訓(xùn)練學(xué)校」。因各種理由而失去了容身之處的少女們，在這裡被賦予了武器，並以國防的名義派遣她們執(zhí)行一個(gè)又一個(gè)危險(xiǎn)的任務(wù)。無論遭受何等苦難，卻選擇拿起武器繼續(xù)戰(zhàn)鬥的少女們的未來會(huì)是……。