瑪利歐和路易吉將探訪漂浮在汪洋大海上的各個島嶼，展開全新的冒險。
故事的舞臺是和蘑菇王國位在不同世界的「柯連庫塔魯大地」。
瑪利歐和路易吉必須齊心協力，解決旅途中阻礙他們的各種困難。
在柯連庫塔魯大地之中，將會遭遇各式各樣的人物，其中有些會協助瑪利歐們，
也有些個性獨特的人物會以敵人身分阻擋在前。
除此之外，也有大家所熟悉的蘑菇王國公主以及烏龜族大魔王等瑪利歐系列人物會登場。
戰鬥方面，將以融入瑪利歐動作要素的指令式戰鬥來進行。
攻擊時抓準時機按下特定按鍵，就能增加造成的傷害，還能讓強大的「兄弟攻擊」成功發動。
而防禦時同樣抓準時機按下按鍵，可以閃躲敵人的攻擊或是造成反擊效果。
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