在《魔法科高中的劣等生》的故事中，魔法不是傳說(shuō)或童話的產(chǎn)物，而是發(fā)展至今將近一個(gè)世紀(jì)的現(xiàn)實(shí)技術(shù)。國(guó)立魔法大學(xué)附設(shè)第一高中──通稱(chēng)「魔法科高中」的這所學(xué)校，將學(xué)生分為成績(jī)優(yōu)秀的「一科生」，以及後備遞補(bǔ)的「二科生」，他們各自被稱(chēng)為「花冠」與「雜草」。而有一對(duì)親兄妹，在今年進(jìn)入魔法科高中就讀。哥哥是背負(fù)某項(xiàng)缺陷的劣等生。妹妹是一切完美無(wú)缺的優(yōu)等生。言行舉止帶著達(dá)觀氣息的劣等生哥哥，愛(ài)慕哥哥之心更勝親情的優(yōu)等生妹妹。從兩人跨入這座名校校門(mén)開(kāi)始，原本和平的校園，即將面臨風(fēng)波不斷的每一天。