在忍者紛爭地的現場，殘留了一個唯一活人藤木戶健二以及兩名忍者─無法者和散布者
伴隨著一句：「忍者都該殺！」突然生存者用強悍的握力抓住了無法者
無法者只一瞬間就被擊倒了。 另一名忍者散布者也被嚇到了，他沒想像過凡人能過對抗忍者。
利用自己傷口的血液，藤木戶健二憑空製造了手裏劍，輕易的殺死散布者
虐殺完散布者，藤木戶就像剛剛製作出手裏劍那樣，用血液完成了血紅色的忍裝
「您好，我是忍者殺手。」縱使是剛才廝殺完的對象，開打前還是一定要說句忍者的問候語。
立刻就被變身完畢的忍者殺手給擊殺了。
幕間─圍毆著醉漢的警察。
忍者殺手、藤木戶經過玻璃窗前，回憶起幾小時前失去的妻兒。
還有殺害他妻兒的忍者─黑暗忍者。
此時讓他得到忍者力量的靈魂─奈洛忍者出現，並讓他與自己一起報仇。殺光所有忍者。
這是黑暗忍者身上的標記，總會屋忍者的標誌！也是忍者殺手終身對抗的對象。
沐浴在重金屬酸雨下的藤木戶，下定決心要成為忍者殺手，殺光所有忍者。而畫面一轉，忍者殺手為了補充剛剛戰鬥的能量而吃著高補給力的壽司。
總會屋的忍者─追隨者騎著機車趕來，要擊殺與總會屋為敵的忍者殺手
面對正體和目的的忍者殺手，追隨著提出了對手目的的疑問。
對於只回答：「殺光所有忍者。」的忍者殺手，追隨者開始了與他的激戰。
即便作為高等級的空手道高手，追隨者也對忍者殺手感到恐懼。
截至目前為止，忍者殺手已經殺了三名總會屋忍者了。 得知消息的總會屋最強忍者─黑暗忍者無言的看向主人。
他的主人正大口的吃下花魁端上的高級壽司。
他的主人正大口的吃下花魁端上的高級壽司。
雖然讓許多粉絲非常不適應，但實際上本作在細節部分的演出還是非常到位的，例如幕間的醉漢、最後的花魁、還有片頭曲中出現的黑道機械人等等、都忠實了呈現了原作那種惡搞的美式幽默韻味。在欣賞這部作品時，強烈建議先把既有的日式動畫印象拋開，改以先行作品和美式風格為前提來觀看，畢竟或許 2016 TV 版播放時，會有著像是《襲來！美少女邪神》FLASH 版和 TV 版那樣的驚人變化也說不定？
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