分佈在學園城市各個地區的<學園>
基本上被認定爲獨立的行政自治區域。

由總管理奇普托斯的
一種聯邦政府的總學生會
管理並控制<學園>的構造。
但是由於總學生會長突然地失蹤，
總學生會陷入癱瘓的狀態，
倚靠總學生會長超乎常人的行政能力而
制止住一時的奇普托斯
各種問題開始浮出檯面。

為了阻止這一切，總學生會請求
聯邦搜查社團 <夏萊>
協助解決奇普托斯的各項問題。
<夏萊>為總學生會長失蹤前
認可的最後一個組織，
是成立不久的新生社團。

現在<夏萊>需要和學生們
一起解決奇普托斯各種事件的導師。

[個人武器和智慧型手機為學生們的必要道具!
學園城市少女們的友情和愛情，
感動的軍事行動!]